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SmallRNA

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項(xiàng)目介紹

Small RNA是一大類(lèi)調(diào)控分子，幾乎存在于所有的生物體中。Small RNA包括：microRNA、ncRNA、siRNA、snoRNA、piRNA、rasiRNA等等。Small RNA通過(guò)多種多樣的作用途徑，包括mRNA降解、翻譯抑制、異染色質(zhì)形成以及DNA去除，來(lái)調(diào)控生物體的生長(zhǎng)發(fā)育和疾病發(fā)生。Small RNA轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是鑒定和定量解析small RNA的新方法和有力工具。

技術(shù)特點(diǎn)

1.可以直接從核苷酸水平上研究Small RNA分子，不存在傳統(tǒng)芯片雜交的熒光模擬信號(hào)帶來(lái)的交叉反應(yīng)和背景噪音問(wèn)題，非常利于區(qū)分相同家族以及序列極為相似的不同Small RNA分子；

2.可以對(duì)任意物種進(jìn)行高通量分析，無(wú)需任何預(yù)先的序列信息以及二級(jí)結(jié)構(gòu)信息。

3.靈敏度高，測(cè)序通量大，為Small RNA分子的發(fā)現(xiàn)和研究提供了極大的數(shù)據(jù)深度與覆蓋率，能夠檢測(cè)豐度極低的稀有轉(zhuǎn)錄；

      4.測(cè)序產(chǎn)生的原始數(shù)據(jù)可以與多種分析軟件兼容，可以注釋Small RNA的基因組信息，并分析其表達(dá)水平，能夠隨時(shí)使用公用Small RNA數(shù)據(jù)庫(kù)注釋已知的Small RNA，還可以進(jìn)一步分析  未匹配的數(shù)據(jù)，發(fā)現(xiàn)新的Small RNA種類(lèi)及異構(gòu)體，尋找更深入的研究信息。

實(shí)驗(yàn)流程

圖中深色為該實(shí)驗(yàn)流程

分析流程

標(biāo)準(zhǔn)分析

（1） 數(shù)據(jù)過(guò)濾及比對(duì)

（2） MicroRNA的比對(duì)分析及預(yù)測(cè)

高級(jí)分析

（3） MicroRNA表達(dá)水平分析

（4）MicroRNA表達(dá)差異性分析


樣品要求

送樣要求

RNA濃度≥200ng/ul，總量≥2ug

細(xì)胞數(shù)≥5ⅹ106

項(xiàng)目案例

對(duì)68個(gè)標(biāo)本的聚類(lèi)分析

亞型差異表達(dá)維恩圖分析

差異表達(dá)基因熱圖分析

學(xué)術(shù)文章

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