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外顯子組(Exome)

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外顯子組(Exome)

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項(xiàng)目介紹

人類(lèi)外顯子組占人類(lèi)基因組長(zhǎng)度的約1-2%,目前估計(jì)能引起的疾病的DNA變異有85%以上來(lái)自于外顯子區(qū)域的變異,同時(shí)由于外顯子測(cè)序能在較低的成本下實(shí)現(xiàn)很高的覆蓋度,使其成為全基因組測(cè)序的經(jīng)濟(jì)替代。

技術(shù)特點(diǎn):

1.直接檢測(cè)編碼蛋白序列,找出與蛋白相關(guān)變異

2.測(cè)序深度達(dá)到150X,可以找出變異頻率低的變異

3.外顯子占全基因長(zhǎng)度1-2%,檢測(cè)費(fèi)用、周期、工作量明顯縮短

實(shí)驗(yàn)流程:


分析流程:

標(biāo)準(zhǔn)分析

(1) 數(shù)據(jù)過(guò)濾及比對(duì)分析

(2) SNP/InDel檢測(cè)及注釋

高級(jí)分析

(3) 家系內(nèi)突變位點(diǎn)比對(duì)

(4) 使用GO/KEGG pathway進(jìn)行突變基因的富集分析。

樣品要求

DNA:濃度10ng/ul  總量:10ug

細(xì)胞數(shù)量:≥5X106

項(xiàng)目案例
學(xué)術(shù)文章

外顯子組(Exome)

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