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二級結(jié)構(gòu)預(yù)測
二級結(jié)構(gòu)是指多肽鏈借助于氫鍵沿一維方向排列成具有周期性的結(jié)構(gòu)的構(gòu)象，是多肽鏈局部的空間結(jié)構(gòu)（構(gòu)象）, 主要有α－螺旋、β－折疊和無規(guī)則卷曲（Coil）三種形式。不同蛋白質(zhì)翻譯后修飾發(fā)生位置在蛋白二級結(jié)構(gòu)上具有一定差異化選擇。例如在某些情況下，蛋白質(zhì)的磷酸化位點傾向于發(fā)生在無規(guī)則卷曲區(qū)域內(nèi)；而在其他情況下，則傾向發(fā)生在結(jié)構(gòu)良好的區(qū)域。該分析結(jié)果用于評估修飾蛋白中修飾氨基酸二級結(jié)構(gòu)的偏好性選擇。
分析方法
采用 NetSurfP1.0 軟件進行二級結(jié)構(gòu)分析，然后 Wilcoxon Rank Sum 檢驗方法計算顯著差異變化 p value。
詳情請聯(lián)系技術(shù)經(jīng)理。
蛋白翻譯后修飾位點二級結(jié)構(gòu)分布統(tǒng)計圖
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