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    預(yù)測納米顆粒穩(wěn)定形貌——Wulff構(gòu)造介紹
    來源:測試GO 時間:2022-08-16 10:39:25 瀏覽:2462次

    一般情況下,液體會有減小表面積的傾向,這種作用力被稱為表面張力。在失重環(huán)境下比如飛船中,水滴完全失重呈現(xiàn)球狀結(jié)構(gòu)這是由于在體積確定情況下,水滴形成球狀結(jié)構(gòu)能夠擁有最小的表面能。

    類似的,對于納米顆粒,在平衡狀態(tài)下也傾向于形成低表面能的晶面,從而決定了納米顆粒的形貌。為了預(yù)測納米顆粒的形貌,Gibbs、Wulff,Herring和Cerf等提出了Wulff構(gòu)造的概念。本文將詳細介紹Wulff構(gòu)造的原理、應(yīng)用和計算。

     一、Wulff構(gòu)造的原理

    Wulff構(gòu)造的理論基礎(chǔ)是Gibbs-Wulff晶體生長定律。Gibbs-Wulff定律表述為:晶體在等溫恒容的情況下,如果晶體的總表面能最小,則相應(yīng)的形態(tài)為晶體的平衡形態(tài)。某一晶面族的線性生長速率與該晶面族的比表面自由能成正比:


    二、Wulff構(gòu)造的應(yīng)用


    Wulff構(gòu)造最早提出應(yīng)用于解釋地質(zhì)學(xué)中礦物結(jié)構(gòu)的形成。近年來,由于科技進步和表征手段的提高,Wulff構(gòu)造被發(fā)現(xiàn)也適用于納米團簇有機晶體和生物體系。

    ACS Catal. 2019, 9, 2768中作者研究了CO覆蓋率、暴露溫度和壓力等影響因素對Ru納米顆粒HCP結(jié)構(gòu)的FCC結(jié)構(gòu)的影響。

    Adv. Mater. 2016, 28, 1697中作者研究了DBTDT晶體的不同晶面的生長模式,證明了有機晶體同樣也滿足Wulff構(gòu)造。

    Nat. Comm. 2021, 12, 3011中作者發(fā)現(xiàn)DNA折紙單晶的形狀也滿足Wulff構(gòu)造。

     

    三、Wulff構(gòu)造的計算


    Wulff構(gòu)造的計算,其關(guān)鍵在于知曉晶體結(jié)構(gòu)和不同晶面表面能的相對大小。以下提供幾種方法,用于繪制簡單納米團簇的Wulff構(gòu)造。

    3.1 Materials Project在線查詢Wulff構(gòu)造

    Materials Project是著名的材料基因組數(shù)據(jù)庫,收錄了很多晶體結(jié)構(gòu)的計算信息。對于Wulff構(gòu)造最重要的表面能信息,可以參考此篇文獻提供的信息。

    其數(shù)據(jù)也可直接從{ HYPERLINK" http://crystalium.materialsvirtuallab.org/" \h}查詢,界面如下:

    點擊進入即可查詢對應(yīng)金屬單質(zhì)的Wulff構(gòu)造和各個晶面的表面能。

    對于編號為mp-2的Pd,其結(jié)構(gòu)Wulff構(gòu)造如圖所示:

    3.2 VESTA中繪制Wulff構(gòu)造

    VESTA可以從https://jp-minerals.org/vesta/en/下載。本部分以上文中的mp-2結(jié)構(gòu)為例,建立對應(yīng)的Wulff構(gòu)造。

    打開VESTA,打開File-New Structure,建立空白結(jié)構(gòu)

    在Unit cell中選取對應(yīng)的空間群,點擊OK

    Edit-Edit Data-Crystal Shape中輸入對應(yīng)的晶面和晶體中心到相應(yīng)晶面的距離,因為晶體中心到相應(yīng)晶面的距離與表面能成正比,故而可用表面能數(shù)據(jù)代替:

    點擊Apply,即可得到相應(yīng)的Wulff構(gòu)造:

    3.3 ASE繪制Wulff構(gòu)造

    使用conda安裝ase:

    conda install ase

    啟動Python環(huán)境,輸入如下代碼

    from ase.cluster.wulff import wulff_construction

    from ase.io import write 

    atoms = wulff_construction('Ru',                       

    surfaces=[(100),(110),(111),(210),(211)],#定義不同的晶面                       

    energies=[0.180,0.190,0.160,0.200,0.190],#定義不同晶面的表面能,需和晶面一一對應(yīng)                       

    size=2700,#定義了納米結(jié)構(gòu)的原子數(shù)                       

    structure='fcc'#納米結(jié)構(gòu)的堆積方式為fcc,此外還可以支持bcc和sc                       

    latticeconstant=3.7476,#晶格參數(shù)為3.7476                       

    rounding='closest'#納米結(jié)構(gòu)最終原子數(shù)可以低于或者高于2700,也可以選擇above和below高于或者低于設(shè)定數(shù)

    write('Ru.xyz', atoms) #導(dǎo)出Ru.xyz的結(jié)構(gòu)文件

    write('Wulff.png', atoms)#導(dǎo)出圖片格式

    具體代碼含義可以參照注釋。

    導(dǎo)出的Wulff.png如圖所示:

    使用VMD進行以下設(shè)置:

     

    得到最終效果如圖所示:

     

    四、總結(jié)

    Wulff構(gòu)造是一種預(yù)測納米顆粒形貌的有效手段。通過查詢Materials Project數(shù)據(jù)庫,結(jié)合VESTA和ASE等軟件,我們可以輕松畫出納米結(jié)構(gòu)對應(yīng)的Wulff構(gòu)造,從而構(gòu)建起宏觀結(jié)構(gòu)與微觀組成的橋梁。


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    12條評論
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    全部 3小時前 四川
    文字是人類用符號記錄表達信息以傳之久遠的方式和工具。現(xiàn)代文字大多是記錄語言的工具。人類往往先有口頭的語言后產(chǎn)生書面文字,很多小語種,有語言但沒有文字。文字的不同體現(xiàn)了國家和民族的書面表達的方式和思維不同。文字使人類進入有歷史記錄的文明社會。
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