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精品干貨：XRD從原始數(shù)據(jù)到圖

來(lái)源：研之成理時(shí)間：2020-04-09 15:10:41 瀏覽：12991次

本文轉(zhuǎn)載自研之成理

前言：

XRD是非常常用的表征手段，前面我們主要從它的用途，具體原理以及實(shí)際操作等幾個(gè)方面進(jìn)行了分享。今天我們將整個(gè)過(guò)程串起來(lái)，給大家一個(gè)直觀的認(rèn)識(shí)，看看XRD如何一步一步從樣品到最后文章中的圖。

通過(guò)上一期的內(nèi)容（從樣品到原始數(shù)據(jù)），大家應(yīng)該大致了解如何通過(guò)多晶衍射儀得到XRD原始數(shù)據(jù)（包括raw和txt兩個(gè)文件）。今天就接著從這里開(kāi)始分享，看看如何從這兩個(gè)原始文件最后變成可用于文章的圖。

1. 基于Jade的物相鑒定方法

簡(jiǎn)單的利用Jade進(jìn)行物相分析的方法，我們?cè)诘诙谝呀?jīng)分享過(guò)了，今天咱們更進(jìn)一步，看看XRD如何分析復(fù)雜的物相，順便對(duì)Jade進(jìn)行較為全面的介紹。

Step 1. 采用jade來(lái)讀取raw文件：如下圖所示

打開(kāi)Jade軟件，F(xiàn)ile-->Read,在彈出來(lái)的窗口中找到目標(biāo)文件所在文件夾，點(diǎn)擊選取目標(biāo)文件（raw文件），然后打開(kāi)。

友情提示：如果覺(jué)得看不清楚，可以點(diǎn)擊圖片，然后就可以方便的放大查看了。

打開(kāi)之后，得到下圖所示界面：

精品干貨：XRD從原始數(shù)據(jù)到圖-2

Step 2: 物相檢索匹配（search/match)

注：在有些教程中，也有說(shuō)采用Jade自帶扣背景功能先扣除背景和刪除雜峰的。這里，小編不推薦，因?yàn)椴捎迷紨?shù)據(jù)進(jìn)行S/M得到的信息是最多的（請(qǐng)讀者根據(jù)實(shí)際情況進(jìn)行斟酌）

采用Jade的S/M功能大致可以分三步走：

A. 無(wú)條件自動(dòng)檢索，具體操作如下圖所示。

精品干貨：XRD從原始數(shù)據(jù)到圖-3

點(diǎn)擊Jade軟件菜單中Identify-->Search/Match setup, 在彈出來(lái)的對(duì)話框中，勾選上subfiles to search中需要的數(shù)據(jù)庫(kù)（一般至少選中Inorganic, Minerals, ICSD patterns以及ICSD minerals這四個(gè)，其他的根據(jù)實(shí)際情況增加）

無(wú)條件自動(dòng)檢索中，不要勾選use Chemistry，直接點(diǎn)擊OK就行。

此時(shí)將會(huì)得到下圖所示界面：

精品干貨：XRD從原始數(shù)據(jù)到圖-4

自動(dòng)匹配后，主要的物相往往能夠識(shí)別出來(lái)，以上圖為例，主要的物相為ZnO（識(shí)別結(jié)果中第一個(gè)即是，F(xiàn)OM值最小表面匹配度最好，從譜圖匹配的情況也可以看出對(duì)應(yīng)得很好）。但是，紅色框中的幾個(gè)峰并不能和ZnO吻合，表面含有其他物質(zhì)，不是單一組成。

怎么辦呢？

B. 這就要用到第二種檢索方法，單峰檢索（或者特定峰檢索）

具體操作為：利用下圖所示“積分”工具，在想要檢索的峰下拉取基線?？梢詥芜x一個(gè)峰，也可以選多個(gè)峰（一般進(jìn)行單峰檢索）。選中該峰之后，再次點(diǎn)擊Search and Match，讓其自動(dòng)檢索。

自動(dòng)檢索的結(jié)果，如下圖所示：

精品干貨：XRD從原始數(shù)據(jù)到圖-6

自動(dòng)檢索的結(jié)果中，F(xiàn)OM值最?。ㄆヅ涠茸詈玫模┑臑锳g，但實(shí)際上我們這里真實(shí)的組成是Au。這也是給大家提個(gè)醒，不要迷信FOM值以及自動(dòng)匹配，Jade不是萬(wàn)能的，不能夠區(qū)分很細(xì)小的差別。實(shí)際上Au和Ag在同一族，都是FCC結(jié)構(gòu)，只是原子大小的差異，因此XRD衍射峰非常類(lèi)似，差異性極小。

在完全不知道組成的情況下只通過(guò)Jade來(lái)斷定物質(zhì)的組成是武斷的，一定要跟其他表征結(jié)果結(jié)合起來(lái)。

當(dāng)然，實(shí)際上，更多的情況下，我們往往知道樣品中含有哪些元素，為了更加準(zhǔn)確地得到物相信息，Jade里面有一個(gè)非常有用的功能，就是限制元素組成，這是jade物相檢索的第三種方法——C. 限定條件的檢索。

這里依舊以剛才的Au那個(gè)峰為例，如果限制元素會(huì)得到怎樣的結(jié)果呢？

如何限定條件？還是剛才的Identify-->Search/Match setup,在彈出來(lái)的框中，不是有個(gè)Use Chemistry嗎？把它勾上就是限定條件了，那么限定的條件是什么呢？點(diǎn)擊Chemistry，在彈出的元素周期表中，點(diǎn)選上你想要的元素（綠色為一定含該元素，灰色為不含該元素，藍(lán)色為可能含有該元素。大家可以根據(jù)實(shí)際情況，靈活選用）

精品干貨：XRD從原始數(shù)據(jù)到圖-7

這里，由于我們確定里面含有Au,想要確定Au的峰，因此點(diǎn)擊兩次Au元素將其變成綠色，然后點(diǎn)擊OK。匹配結(jié)果如下：

精品干貨：XRD從原始數(shù)據(jù)到圖-8

我們可以看到，圖中的幾個(gè)峰與Au完全能夠匹配上，因此確定了整個(gè)物質(zhì)的組成為ZnO+Au。

當(dāng)然，這里只是舉個(gè)比較簡(jiǎn)單的例子，在實(shí)際情況中可能有些情況會(huì)比較復(fù)雜。但是基本上，利用jade來(lái)進(jìn)行物相分析的方法就是以上三種，大家在實(shí)際操作中要靈活使用，特別是單峰檢索以及限定條件檢索。（如果大家遇到問(wèn)題，可以在QQ群里面求助，相信群里面有很多大牛能夠解答大家的問(wèn)題）

在完成檢索之后，大家還會(huì)用到的一個(gè)功能是，如何提取表征卡片的信息？

雙擊Search and Match結(jié)果中所匹配上的PDF卡片，會(huì)彈出一個(gè)寬口，窗口中reference欄中標(biāo)記出了相應(yīng)的參考文獻(xiàn)，點(diǎn)群等信息；而點(diǎn)擊line就可以得到標(biāo)準(zhǔn)卡片的信息值，包括2 theta, d值， hkl等，如上圖所示。而點(diǎn)擊export可以導(dǎo)出這個(gè)數(shù)據(jù)表。（主要看大家的實(shí)際需求）

以上為整個(gè)XRD的分析過(guò)程，希望能夠讓大家明白整個(gè)過(guò)程是怎么回事。

2. 基于origin的XRD數(shù)據(jù)作圖

Origin作圖我們前面已經(jīng)分享很多了，本來(lái)不需要多說(shuō)，但是為了讓整個(gè)過(guò)程更加完整，這里補(bǔ)充一點(diǎn)內(nèi)容，著重強(qiáng)調(diào)圖中的一些注意點(diǎn)。

A. 數(shù)據(jù)導(dǎo)入（基于txt文件）以及做線性圖是origin中最基本的，前面已經(jīng)分享了，這里不多說(shuō)。

精品干貨：XRD從原始數(shù)據(jù)到圖-10

B. XRD譜圖格式

XRD定性分析中，縱坐標(biāo)衍射峰強(qiáng)度的數(shù)值不是特別重要，在譜圖中可以不顯示，相應(yīng)地其縱坐標(biāo)為Intensity (a.u.),請(qǐng)注意Intensity和(a.u.)之間需要有空格。而橫坐標(biāo)是非常重要的，要顯示數(shù)值且選擇的間距要合適,橫坐標(biāo)為2 theta (degree).

origin如何優(yōu)化譜圖可以參見(jiàn)：圖形美化之一。重點(diǎn)是：譜線與坐標(biāo)軸線條大?。?/span>一般為3，顯示四個(gè)邊框，除底邊外，其他軸均不含刻度），橫縱坐標(biāo)字體大?。?/span>一般為28, Arial, 粗體），譜線類(lèi)型為B-spline。此外，要合理調(diào)整譜圖顯示范圍。具體如下圖所示：

C. XRD譜圖中其他附加信息

有些情況下，人們?yōu)榱俗尨蠹腋忧逦鷺悠返奈锵嘟Y(jié)構(gòu)，會(huì)對(duì)樣品的晶型結(jié)構(gòu)進(jìn)行標(biāo)注（有些情況下，大家會(huì)直接將hkl值標(biāo)記在峰上，這個(gè)視具體情況而定）。大家可以采用導(dǎo)出的PDF卡片，通過(guò)圖層的形式做到譜圖下面（直接顯示標(biāo)準(zhǔn)卡片的XRD譜圖或者采用豎線顯示特征峰位置）。簡(jiǎn)單一點(diǎn)的，也可以直接采用符號(hào)（符號(hào)大小可以統(tǒng)一為12）標(biāo)記出各個(gè)峰的歸屬（請(qǐng)根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)卡片所示的2 theta值等進(jìn)行標(biāo)定），如下圖所示：

精品干貨：XRD從原始數(shù)據(jù)到圖-12

精品干貨：XRD從原始數(shù)據(jù)到圖-13

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